Đức Giáo Hoàng Innôcentê IX sinh ngày 20-7-1519 tại Bôlonia, tên thật là Giovanni Antonio Facchinetti. Dưới thời đức Piô V là Hồng y làm Khâm sứ Tòa thánh tại Venise, ngài đã vận động để thành lập liên minh chống quân Hồi Giáo Thổ Nhĩ Kỳ với chiến thắng tại vịnh Lêpantô. Ngài được bầu chọn làm Giáo hoàng ngày 29-10-1591, đăng quang ngày 3-11-1591 với danh hiệu Innôcentê IX.
Do tuổi cao, sức yếu, sau khi đắc cử Giáo hoàng, ngài phải nằm liệt trong hai tháng. Lúc này một cơn dịch hành lớn đang xảy ra tại Rôma, gây nhiều khốn đốn cho dân thành. Giáo triều của ngài khá ngắn ngủi, ngài qua đời ngày 30-12-1591.